基于COI研究三角鲂的遗传多样性开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

三角鲂（megalobrame terminalis），隶属于鲤形目，鲂属，因其背鳍高、头尖尾长，从侧面看形似三角形而得名。三角鲂是我国重要的经济鱼类之一，其体大肉厚，肉质嫩滑，受消费者的喜爱。其分布范围广，主要分布在东南沿海，长江水系、黄河水系、黑龙江水系，存在于我国大部分的水域区域^[1,2]。三角鲂生活在江河以及湖泊的中下层鱼类，对于水体中的溶氧要求较高，但对温度适应的范围较广。钱塘江是浙江的第一大江，也是母亲河。历史上，钱塘江渔业资源丰富，盛产富春江鲥鱼、鲈鱼、塔鳊（三角鲂）、子陵鱼（吻鰕虎鱼）等多个品种^[3]。钱塘江是三角鲂资源丰富的重要流域之一^[4,5]，沿钱塘江流域至少有6个良种场可为钱塘江提供进行增殖放流活动的三角鲂冬片。

遗传多样性的研究方法主要有形态学标记、细胞学标记、生化标记和分子标记法等，其中形态学方法的受环境、人为因素影响，不能真实全面反映遗传多样性；细胞学标记标记数目有限且受实验条件限制，得不到准确性较高的结果，生化标记数目仍受限制且不具有共显性，但分子标记更加能够准确而快速鉴定个体^[6]，成为研究遗传多样性的最优方法。分子标记包括核基因和线粒体基因，其中线粒体细胞色素c氧化酶亚基i (cytochrome c oxidasesubunit i, coi) 基因5’端有一段约650 bp的序列，是线粒体中最保守的基因，具有进化速率高、种间变异明显而种内相对保守、且引物通用性好和易于扩增的特点,已经在鱼类等生物类群的遗传多样性分析和系统进化分析方面^[7,8]得到了应用。

综上可知，本项目是运用coi基因进行三角鲂遗传多样性的分析是有理论依据的。分析遗传多样性对于种质资源保护和养殖业的可持续发展至关重要，为物种进化和遗传育种提供了基础。因此，对于三角鲂这个群体进行遗传多样性的研究十分的重要，期望能为保护和开发三角鲂的种质资源和可持续利用提供理论依据和基础数据。

2. 研究的基本内容和问题

研究目标

采集沿钱塘江流域的两个良种场三角鲂鳍条样本、三个三角鲂放流区域的鳍条样本以及钱塘江捕捞群体的鳍条样本，提取鳍条样本的dna，通过pcr技术扩增coi基因序列，通过机器检测出基因序列，通过软件分析数据得出遗传多样性和遗传分化程度，为种质资源保护和养殖业的可持续发展提供数据支撑，为保护和开发三角鲂的种质资源和可持续利用提供理论依据。

研究内容

3. 研究的方法与方案

研究方法

dna提取，pcr扩增，琼脂凝胶电泳，数据软件分析

技术路线

4. 研究创新点

特色或创新之处

基于分子标记，利用线粒体中最保守的基因进行测序，通过软件分析数据得到遗传距离，遗传分化，遗传多样性等数据，来判断三角鲂群体遗传多样性情况，为种质资源保护和养殖业的可持续发展提供数据支撑，为保护和开发三角鲂的种质资源和可持续利用提供理论依据。

5. 研究计划与进展

研究计划及预期进展

① 2019年9月-11月 与指导老师交流沟通，确定正确的研究思路，明确目前研究的不足之处，通过各种途径学习与本研究相关的知识以解决研究过程中将遇到的问题。拟定具体的研究方案，并打印成表，以便严格按照计划实验。向老师请教并确定研究过程中所需的材料和相应的仪器设备以及相关所需掌握的实验技术，并且通过实验课及书本熟悉仪器的原理和基本操作方法，为研究做好充足准备。

② 2019年12月 按照实验方案整理出湖州东林镇景山良种场、杭州市箫山瓜沥镇柏松良种场、余杭区钱塘江放流现场、桐庐钱塘江放流现场、建德钱塘江放流现场、钱塘江中下游的三角鲂鳍条样本，提取鳍条dna，通过pcr技术扩增coi序列，分析各三角鲂群体遗传多样性和遗传结构。