基于转录组的鱼虾精巢差异表达基因分析开题报告

本课题的意义、国内外研究概况、应用前景等（列出主要参考文献）

21世纪以来，随着经济的发展和生活水平的提高，国民对于动物性食物的需求量快速增长，而水产养殖业是其增长速度最快的领域。然而基础理论研究滞后于水产养殖业的快速发展，导致鱼虾自然种质资源退化、病害频发等问题日渐严重。水产养殖育种方面早期研究基本上都是利用表型选择来挑选优良性状的亲本，这种方法受到环境因素和选择强度的干扰，遗传力较低的性状将难以通过该方法进行选育，只有遗传力强的性状才能进行选育；而杂交回交技术进行选育时难以检测出遗传上的优良个体，需要通过不断地回交才能获得稳定的优良品种，花费较多人力和物力[1]。随着科技的进步，以基因组学、转录组学等技术也逐渐运用到水产中，转录组数据的分析能够让人了解基因的差异表达，对关键的基因和代谢通路定位，并找到与其关联的特定生理现象，这为研究生物生长发育等提供了有效帮助[2-3]，也对水产动物传育种有一定的帮助。鱼类与甲壳类，营养丰富肉质鲜美,深受人们喜爱，有很高的经济价值。同时随着凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）的快速发展，我国成为全球第一养虾大国[4]。若将先进的现代生物技术应用于水产养殖遗传育种中，通过转录组学研究，寻找甲壳类和鱼虾性腺之间的共有特征和各自特点，建立基因池，并通过转基因等技术，打破物种间遗传物质间的屏障，解决各自的繁殖育种、生长发育等问题，不仅能满足人们对于数量和质量的需求，还有利于我国水产业的种质资源的可持续发展[5-8]。

在鱼类和甲克壳类中，很多物种存在性别二态性，比如不同性别间生长速度等存在明显差异，罗非鱼雄性生长速度高于雌性，对虾类雌性生长速度大于雄性，通过控制性别进行单性养殖能大大提高养殖效益[9-11]。为了深入了解这种性别二态性现象出现的原因，国内外已有许多学者对水产动物性腺差异表达基因进行分析，Jinxia Peng[12]等分析了南美白对虾雌雄性腺的差异表达基因，Tao W[9]等分析了尼罗罗非鱼乳化后5天、30天和180天雌雄性腺的差异表达，孙业盈[13]分析了导致半滑舌鳎雌雄精巢重量差异的基因表达。然而目前关于水产动物性腺差异表达基因的研究，大多数是对同一物种不同性别的基因研究，对于不同物种同一性别的性腺差异表达基因的分析较为稀少。

本课题选取世界上三大养殖对虾中单产量最高的凡纳滨对虾，成年雄虾的精巢数据，以及被誉为未来动物性蛋白质主要来源之一的尼罗罗非鱼[14]，孵化后30天和180天的精巢数据，进行差异表达基因分析。通过寻找鱼类和甲壳类之间的共有特征和各自特点，建立基因池，为未来通过转基因等生物技术，解决他们各自的育种、养殖等问题提供参考，有着极大的应用前景。

参考文献

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