猪抗性候选基因IL8的鉴定分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

意义：白细胞介素8 (interleukin 8，il-8)，又称为趋化因子cxcl8，是体内炎性反应应答的主要介质之一，也是巨噬细胞和上皮细胞等分泌的细胞因子，它的趋化活性对不同粒细胞各有差异[1]。

该基因能促进炎性反应进程、刺激血管形成、调节宿主免疫等功能，与多种炎性反应性疾病、肿瘤的发生密切相关。

肿瘤及肿瘤基质细胞分泌的白细胞介素8(il8)也是一重要的血管生成因子,它可通过肿瘤及肿瘤血管内皮细胞表面的受体,直接或间接促进肿瘤细胞的增生、新生血管的形成,从而促进肿瘤的生长和转移[2]。

2. 研究的基本内容和问题

研究目标在大白猪和长白猪免疫应答表达基因mrna测序结果的基础上，选取白细胞介素8作为猪优异抗性基因作为候选基因，进一步寻找和鉴定il 8基因中的snp突变位点，并与猪相关免疫性状做相关分析，验证白细胞介素8在抗性基因的重要影响及作用。

研究内容引物的设计：在已知il 8基因的碱基序列，通过primer 5.0软件设计特异性引物 ，根据外显子区域的碱基序列设计的引物交由上海生工生物公司合成。

snp突变位点的寻找与鉴定：经采用长白猪和大白猪组织dna进行25微升体系的pcr扩增，通过跑胶，成功获得各个外显子pcr片段，将所得产物经过直接测序得到序列，进行序列对比寻找到外显子区域的snp位点。

3. 研究的方法与方案

1、研究方法 本实验基于rna-seq测序结果和数据处理与分析等技术，筛选出差异表达基因，在差异表达基因的结果中选出效应显著的候选基因il8。

对il8基因外显子区域进行pcr扩增，得到大白猪和长白猪两猪种的il 8基因全部外显子片段，利用pcr产物直接测序，获得基因序列，并对比筛查到il 8的功能snp位点，利用pcr产物直接测序技术对猪资源群体进行snp基因分型。

2、技术路线

4. 研究创新点

通过对白细胞介素 8基因的功能SNP位点的筛查与鉴定，从而了解白细胞介素8基因的抗性相关作用，为进一步标记辅助选择培育具有抗性的猪新品系提供理论依据和科学参考。

5. 研究计划与进展

研究计划及预期进展2015.04～2015.11：差异表达基因筛选、文献综述的提交、引物设计与合成。

2015.11～2016.03：鉴定il 8基因， pcr扩增、测序、寻找功能snp位点、相关分析。

2016.04～2016.05：数据的整理，毕业论文的书写与完成、完成结题工作、毕业答辩。