银杏异戊二烯基因转移酶相关基因的克隆及序列分析开题报告
2021-08-08 03:17:42
1. 研究目的与意义
银杏叶的有效药用成分为黄酮类和萜内酯类,本实验通过对银杏异戊二烯基因转移酶相关基因的克隆及序列分析,希望对银杏异戊二烯代谢途径能有一个更加深入的了解,为古老的孑遗植物银杏的深入研究提供理论基础。
2. 国内外研究现状分析
植物类异戊二烯化合物代谢途径的基本框架已初步探明。在代谢途径分子调控及代谢工程的研究方面也已取得了不少的进展,但这些研究都局限于拟南芥、番茄、水稻、橡胶等模式植物及部分经济作物上,而对于不少多年生果树及中药类等具有重要经济价值的作物中类异戊二烯化合物代谢的研究才刚刚开始起步。
异戊二烯转移酶的一些基因从生物中分离,多个GGPP合成酶基因已从Capsicum anuum和Arabidopsis中被克隆,FPP合成酶基因也已从鸟肝、酵母、鼠肝中分离。通过比较来自植物、动物、真菌的异戊二烯转移酶的氨基酸序列,发现其中有5个区域在氨基酸序列上具有高度的相似性。关于银杏异戊二烯转移酶基因克隆的尚不清楚。3. 研究的基本内容与计划
从银杏中提取rna,将其反转录成cdna,从转录组数据中筛选出异戊二烯转移酶相关基因的克隆,对这些基因进行生物信息学分析,从而对银杏异戊二烯代谢途径能有一个更加深入的了解。1.设计3race、5 race引物扩增基因片段,后拼接,验证;
2.根据获得的基因全长及orf阅读框进行生物信息学分析。
实验数据采集及处理
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4. 研究创新点
利用RACE技术克隆银杏异戊二烯基因转移酶相关基因,进行分析。
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