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Bioperl分析环境构建及浙江红山茶DFR基因的生物信息学分析开题报告

 2021-08-08 03:01:51  

1. 研究目的与意义

通过对实验室之前积累的多种林木EST序列的生物信息学分析,并充分利用网络资源,从而能够对林木这一重要物种有更加全面深入的理解。而树种与其他物种之间的共性和差异,借助林木之间以及林木和其它物种的对比分析,也能够更好地揭示林木中一些重要基因的进化关系,为之后的研究打下良好的基础。

2. 国内外研究现状分析

对重要物种的生物信息学分析是当下生命科学的热点,在一些模式生物,如人类和拟南芥中尤为如此,但对于林木重要基因的生物信息学分析尚处于起步阶段,研究内容大多比较局限,系统化的统一式分析研究内容还比较少,这也与林木庞大的基因组有关系

3. 研究的基本内容与计划

在充分利用网络工具的基础上,对实验室之前454测序得到的大量EST序列进行生物信息学分析,灵活运用DNATOOLS, MEGA, Clustal X, MEME, BLAST等分析软件,实现林木间重要基因的序列比对,系统树构建,表达蛋白分析,染色体定位和基因表达模式分析等基本目的,并学会适当优化算法,更高效地从中发掘有价值的生物信息。

4. 研究创新点

计划对林木间重要基因进行系统全面的生物信息学分析,研究角度相对更深入。

查阅文献可得,对于林木重要基因组的生物信息学研究尚处于起步阶段,尤其在一些重要的经济林木中,目前的研究进展更为缓慢。

反观动物和草本植物,研究开展的更为全面,因此希望本研究能为林木重要基因组的比较研究提供参考信息。

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