基于白背飞虱EST的微卫星开发开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

本研究的意义: 白背飞虱具有远距离迁飞习性，是我国和许多亚洲国家当前水稻上的首要害虫。而微卫星dna 标记作为一种多态性和稳定性高、重复性好、呈共显性的分子遗传标记技术,目前已被广泛应用于昆虫学的研究中。通过基于白背飞虱est 的微卫星开发，研究相关物种基因流，从而揭示中国白背飞虱的种群遗传结构，分析其进化并进一步了解其迁飞。

应用前景：尽管est-ssr 标记的研究尚处于初级阶段，开发的时间还不长，使用的范

围也有限，但est 数据资源的不断丰富使得利用est库建立ssr 标记成为一条简便

2. 研究的基本内容和问题

研究目标：

(1)利用微卫星标记的方法，揭示中国白背飞虱的种群遗传结构，揭示其迁移路径。

内容：

3. 研究的方法与方案

一 数据处理

n 以fasta格式下载ncbi上登入的所有est 序列，共37348 条。

n est-teimmer softerware来去除est噪音，筛选有效的est序列；参数设置为：

4. 研究创新点

特色或创新之处

本实验将研究基因功能常用的est 运用于白背飞虱ssr开发，提供了较好标记。利用est 数据库方法开发微卫星的优势和创新有：

n est 数据库免费,与传统的微卫星开发方法相比，相当于构建了一个免费的现成的cdna 文库；而且省去了用基因探针寻找微卫星的步骤所需的费用，试验中使用的寻找微卫星的软件相当于一个电子探针，免费寻找出微卫星。

5. 研究计划与进展

白背飞虱est-ssr 开发

2013.8 主要是学习翻译国内外关于微卫星开发的相关论文

2013.9 上旬熟悉昆虫生态实验室，熟悉pcr以及电泳等相关操作、练手