球头三型孢菌代谢木糖制备苏糖醇代谢途径构建开题报告

 2023-10-10 15:07:13

1. 研究目的与意义

球头三型孢菌研究背景:

球头三型孢菌(trichosporonoides oedocephalis)可耐受20%-60%(w/v)的葡萄糖,可以产生多种多元醇,比如赤藓糖醇、甘油、核糖醇等。球头三型孢菌可以通过ppp途径将葡萄糖转化为赤藓糖。本次实验将外源基因导入球头三型孢菌从而构建球头三型孢菌工程菌,通过菌体自身代谢将木糖转化为赤藓糖醇,然后通过表达导入的基因将赤藓糖醇转化为苏糖醇。通过菌体自身代谢木糖产生赤藓糖醇的菌主要从土壤、新鲜花粉、蜂蜜及蜂巢中分离出来。利用高浓度的葡萄糖培养基(葡萄糖浓度40%-50%),选择存活菌种接种于中浓度葡萄糖培养(20%-30% )中进行发酵,再利用薄层层析和高效液相色谱等方法分析筛选出赤藓糖醇产生菌,并测定其产量,筛选出高产菌种。国外对于赤藓糖醇菌株的选育方面研究较早:1956年加拿大科学家spencer等人在研究高渗酵母产生甘油时,发现由于菌种的生长速度及培养条件的不同,可产生赤藓糖醇;1964年hajny等人从新鲜花粉中分离出一株圆酵母(torula sp.),转化率达到35%-40%;1989年ishizuka等人筛选出aureoasidi-um sp.sn-115菌株;1993年marina等人从蜂巢中分离出 trichosporonoides sp.150-5331-1,它们可利用葡萄糖或蔗糖作为碳源发酵产生赤藓糖醇,转化率分别为30%和43%;1996年kim等人从蜂巢中分离出一株candida magnoliae,转化率为20%;1998年jin等人从蜂巢中分离出一株trichosporon sp.,该菌的转化率达到47%;1999年hirata等人从新鲜花粉中分离出一株ustilaginomycetes sp.618a-01,该菌在发酵过程中不会产生副产物甘油及阿拉伯糖醇等其他多元醇,且发酵起泡现象不明显;2001年lin等人从花粉和蜂蜜等中分离出6 株高渗酵母(moniliella sp.),转化率为37%;2009年jeya等人从污泥中分离出一株p.tsukubaensis kn75,利用葡萄糖作为碳源,经补料分批发酵,其转化率达到61%,是迄今报道赤藓糖醇产生菌中产量的最大者。国内起步较晚,吴艳等人(2001)、陶军玮等人(2003)、杨晓玮等人(2005)及叶娴等人(2007)先后从不同来源中分离得到赤藓糖醇的产生菌,但产率均偏低。经过众多研究总结发现,赤藓糖醇的生产菌株可分为酵母菌、霉菌和细菌,其工业生产中以耐高渗酵母发酵为主。目前国内外研究人员,主要在筛选出高产菌株的基础上,对其发酵培养基、发酵条件和发酵方式等条件进行优化,进一步达到高产的目的。

木糖研究背景:

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2. 研究内容和预期目标

研究内容

本研究立足于国内外研究现状,构建能代谢木糖的球头三型孢菌工程菌,使之能生产苏糖醇。具体研究内容如下:

1)scheffersomyces stipitics cbs 6054木糖醇脱氢酶xdh的合成。

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3. 研究的方法与步骤

研究方法
球头三型孢菌(trichosporonoides oedocephalis)可耐受20%-60%(w/v)的葡萄糖,可以产生多种多元醇,比如赤藓糖醇、甘油、核糖醇等。球头三型孢菌可以通过ppp途径将葡萄糖转化为赤藓糖。本次实验将外源基因导入球头三型孢菌构建球头三型孢菌工程菌,通过菌体自身代谢将木糖转化为赤藓糖醇,然后通过表达导入的基因将赤藓糖醇转化为苏糖醇。
木糖醇脱氢酶(xylitol dehydrogenase),是参与木糖代谢的关键酶之一。不同的木糖醇脱氢酶,在性质上也存在差异,但在蛋白序列和酶学表征上有一定的相似点,大都为nad 辅酶依赖型。大多数木糖醇脱氢酶属于中链脱氢酶家族,一个亚基有300-400 个氨基酸组成,酶活性中心序列有较高保守性。木糖醇脱氢酶(xdh)基因,可以将工程菌菌体自身代谢产生的赤藓糖醇转化为苏糖醇。
实验所运用的表达载体是pyes2,pyes2是一个5.9 kb的载体,设计用来在酿酒酵母(saccharomyces cerevisiae)中诱导表达重组蛋白。载体的特点在于基因插入载体的构建简单,以及能够使用原养型尿嘧啶进行转化株的筛选。酵母gal1启动子,能够在酿酒酵母中被半乳糖诱导表达目的蛋白,同时能够被葡萄糖抑制表达;多克隆位点可以使用的很多限制酶切位点,便于基因插入;cyc1终止子能够有效终止mrna的转录;能够利用ura3基因筛选带有ura3基因型的酵母宿主菌株转化子;氨苄抗性基因能够方便在大肠杆菌中的进行载体筛选。

氨苄西林是一种广谱抗生素,可以杀死多种革兰氏阴性菌或是阳性菌。我们所运用的质粒pyes2中含有β-内酰胺酶(β-lactamase),其可以将氨苄结构中的四元内酰胺环(β-内酰胺(β-lactam))水解,使其失去药性。由此,转化成功的细菌会携带这种基因,从而表达β-内酰胺酶,在有氨苄西林的环境下生存下来,而那些转化失败的细菌将无法生长。

步骤

1.目的基因xdh的合成

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4. 参考文献

[1] Chi P, Wang S, Ge X, et al. Efficient threitol production by an engineered strain of Yarrowia lipolytica overexpressing xylitol dehydrogenase gene from Scheffersomyces stipitis. Biochemical Engineering Joural.
[2] Wong Johanna W-H et al. Comparative metabolomics implicates threitol as a fungal signal supporting colonization of Armillaria luteobubalina on eucalypt roots.[J]. Plant, cell amp; environment, 2020, 43(2) : 374-386.
[3]李良智,尤吉,王伟,扶教龙.核糖醇发酵工艺研究[J].生物技术,2011,21(01): 88-91.
[4]陈叶福,王正祥,方慧英,诸葛健.Pichia stipitis木糖醇脱氢酶基因XYL2在酿酒酵母中的表达[J].无锡轻工大学学报(食品与生物技术),2003(02):26-29.
[5] Rosa Garcia Sanchez, Kaisa Karhumaa, Violeta Snchez Nogu, et al. IR Improved xylose and arabinose utilization by an industrial recombinant Saccharomyces cerevisiae strain using evolutionary engineering[J]. Biotechnology for Biofuels, 2010, 3:13 .
[6] Garca Ros Estfani et al. Thermo-adaptive evolution to generate improved Saccharomyces cerevisiae strains for cocoa pulp fermentations[J] . International Journal of Food Microbiology, 2021, 342(prepublish): 109077-.
[7] Hu Yating et al. Engineering Saccharomyces cerevisiae cells for production of fatty acid-derived biofuels and chemicals. [J]. Open biology, 2019, 9(5) : 190049.
[8] Saccharomyces cerevisiae; Reports from Shandong University Add New Data to Findings in Saccharomyces cerevisiae(Engineering of Saccharomyces cerevisiae for the efficient co-utilization of glucose and xylose)[J]. Journal of Engineering, 2017:1420-.
[9] Huang Hua et al. A General Strategy for the Discovery of Metabolic Pathways: d-Threitol, l-Threitol, and Erythritol Utilization in Mycobacterium smegmatis.[J]. Journal of the American Chemical Society, 2015, 137(46) : 14570-3.
[10] Yu-Ting Chou et al. Identification of a noncanonical function for ribose-5-phosphate isomerase A promotes colorectal cancer formation by stabilizing and activating β-catenin via a novel C-terminal domain.[J]. PLoS Biology, 2018, 16(1) : e2003714- e2003714.

5. 计划与进度安排

1)2024-03-01~2024-03-11:查阅资料撰写开题报告。

2)2024-03-11~2024-03-18:进行scheffersomyces stipitics cbs 6054木糖醇脱氢酶xdh的合成。

3)2024-03-19~2024-04-01: 含重组载体pet28a大肠杆菌bl21的构建、蛋白表达和酶反应实验。

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