狗尾草GASA基因家族生物信息学分析及其在不同逆境下表达模式开题报告

 2023-02-19 08:02

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

gasa (gibberellic acid-stimulated arabidopsis)蛋白是一类crp蛋白(c-reaction protein),对植物的生长发育和应激反应具有重要作用[1-2]。gasa家族在植物中分布广泛,编码基因数量众多,目前已在拟南芥(arabidopsisthaliana)、小麦(triticumaestivum l.)[3]和水稻(oryzasativa)等物种中分离鉴定出相关的gasa基因和蛋白,大多数成员受赤霉素(gibberellic acid,ga)调控[4]。狗尾草是研究c4光合作用的优秀模型[5],目前狗尾草作为c4模式植物的研究在国外越来越热门,而国内对其研究较少。赤霉素调节的gasa基因家族是植物特有的转录因子家族,在调控植物生长发育和逆境响应中起重要作用。目前对狗尾草gasa基因家族全基因组分析的研究尚未见报道。

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2. 研究的基本内容和问题

1、研究目标:

通过生物信息学方法鉴定狗尾草中gasa家族基因序列,通过实时荧光定量pcr技术检测其在干旱、冷害、盐害三种不同逆境条件下的表达模式,为进一步探讨狗尾草gasa基因家族的功能奠定基础。

2、研究内容:

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3. 研究的方法与方案

1.技术路线:

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4. 研究创新点

本研究利用生物信息学方法,首次鉴定了C4模式植物狗尾草GASA基因家族,并对其进行表达水平分析,为后续狗尾草GASA家族基因功能的研究奠定了工作基础。

5. 研究计划与进展

研究计划:

2019.10-2019.11狗尾草gasa基因相关生物信息学信息检索与分析,狗尾草材料培养

2019.12-2020.01实验样品的采集以及相关的定量分析

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