不对称PCR制备单链DNA适配体的优化研究开题报告

 2023-10-12 11:47:14

1. 研究目的与意义

研究背景

一、核酸适配体的概念

核酸适配体(aptamer),简称适配体,是从人工合成的寡核苷酸文库中筛选得到的,与靶标分子具有高亲和力和特异性的单链dna或rna,也被称为化学抗体。它们可以通过折叠形成各种二级结构(例如:茎、环、号角、假结、g-四联体和kiss发夹等),这些二级结构的任意组合即可形成独特的三维结构,通过疏水、静电、氢键、范德华力、形状互补和碱基堆积等相互作用可对同源目标进行特定的分子识别。

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2. 研究内容和预期目标

本论文拟改进不对称pcr技术,对制备单链dna适配体的反应体系和反应条件进行优化。

研究内容

(1)优化常规的对称pcr反应,在此基础上初步建立不对称pcr反应体系,设定反应条件。

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3. 研究的方法与步骤

实验研究方法

(一)优化常规的对称pcr反应,扩增dsdna;

(二)以dsdna产物为模板,运用不对称pcr方法制备单链dna。

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4. 参考文献

[1] 李亚楠, 赵洁, 张傲哲, 等. 核酸适配体的体外筛选方法的最新研究进展[j]. 生物技术通报, 2017, 3(4): 78-82.

[2] 杨歌, 魏强, 赵新颖, 等. 蛋白质的核酸适配体筛选的研究进展[j]. 色谱, 2016, 34(4): 370-381.

[3] 孙玉琼, 袁宝银, 邓美桃, 等. 核酸适配体序列优化策略的研究进展[j]. 化学传感器, 2018, 28(2): 12-22.

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5. 计划与进度安排

(1)2024-2024-1学期第17周~2024-2024-2学期第1周(2024.12.19~2024.2.26):查阅资料,准备开题报告,外文文献翻译;

(2)第2周~第4周(2024.2.27~3.19):预实验,配制相关试剂,练习pcr技术,优化常规的对称pcr反应;

(3)第5周~第8周(2023.3.20~4.16):进行不对称pcr反应,优化反应体系和条件;

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